Aplicação de ferramentas genômicas na avaliação genética da idade ao primeiro parto em búfalas da raça Murrah
A idade ao primeiro parto (IPP) é uma das características reprodutivas mais importante em um rebanho leiteiro, pois está associada ao início da vida produtiva das fêmeas. No entanto, a IPP tem estimativa de herdabilidade baixa, com maior parte da variância fenotípica composta por fatores ambientais....
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| Tipo de recurso: | tesis doctoral |
| Estado: | Versión publicada |
| Fecha de publicación: | 2023 |
| País: | Brasil |
| Institución: | Universidade Estadual Paulista (UNESP) |
| Repositorio: | Repositório Institucional da UNESP |
| Idioma: | portugués |
| OAI Identifier: | oai:repositorio.unesp.br:11449/244600 |
| Acceso en línea: | http://hdl.handle.net/11449/244600 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | Alfabeto bayesiano Bubalus bubalis Frequentista Interação genótipo-ambiente Reprodução SNP |
| Sumario: | A idade ao primeiro parto (IPP) é uma das características reprodutivas mais importante em um rebanho leiteiro, pois está associada ao início da vida produtiva das fêmeas. No entanto, a IPP tem estimativa de herdabilidade baixa, com maior parte da variância fenotípica composta por fatores ambientais. O ambiente é um fator determinante para a expressão e funcionalidade dos genes, e a interação entre os genes e o ambiente são responsáveis pelas variações fenotípicas das características. Assim, é importante que o efeito da interação genótipo-ambiente (IGA) seja incluído em avaliações genéticas para identificar a sensibilidade dos animais em uma ampla gama de condições ambientais. Uma das formas de aumentar o desempenho reprodutivo das fêmeas, é por meio da seleção de animais robustos, e por meio da compreensão da base molecular subjacente à IGA da IPP. Além disso, a inclusão de informações genômicas pode contribuir para maiores ganhos genéticos de características de baixa herdabilidade como a IPP, pois fornecem avaliações genéticas mais acuradas e menos tendenciosas que os modelos tradicionais. Existem diferentes métodos que podem ser utilizados para a predição genômica, no entanto, estes podem diferir na capacidade preditiva dos valores genômicos. Dessa forma, os objetivos deste estudo foram: i) avaliar a IGA da IPP por meio do modelo de norma de reação (RNM); ii) avaliar a habilidade de predição do RNM obtidos via BLUP e ssGBLUP; iii) identificar genes relacionados a IGA da IPP e iv) avaliar a acurácia e a dispersão das predições genômicas para a IPP em búfalos Murrah utilizando PBLUP, ssGBLUP, WssGBLUP e ssBR (ssBA, ssBBπ, ssBCπ, ssBL e ssBRR). Foi observado um efeito importante da IGA na IPP, com incremento de acurácia nos valores genéticos preditos para o intercepto e inclinação da RNM quando foram incluídas informações genômicas. Foram identificadas regiões genômicas importantes decorrentes dos efeitos de IGA sobre a IPP. Após análise funcional, foram detectados cinco genes principais, envolvidos em dois processos biológicos ligados ao metabolismo de lipídios e a imunidade. Os métodos de predição indicaram que a utilização de informação genômica pode melhorar o ganho genético para a IPP, aumentando a acurácia e reduzindo a inflação/deflação das predições desta característica em comparação com o modelo tradicional baseado em pedigree. Além disso, entre todos os modelos genômicos de passo único estudados, o WssGBLUP e o ssBA foram os métodos mais vantajosos a serem utilizados na avaliação genômica da IPP de búfalos desta população. |
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